La Universidad Intercultural de Jalisco se ubica en la Localidad Indígena de Bajío del Tule, que pertenece a la comunidad de San Sebastián Teponahuaxtlán y su anexo Tuxpan, en los municipios de Mezquitic y Bolaños.

Tiene una población total de 163 personas de los cuales 140 hablan una lengua indígena y su población económicamente activa es de 14 personas, así mismo cuenta con 43 viviendas (INEGI 2020), se encuentra a 320 kilómetros de la capital del Estado de Jalisco; los municipios más cercanos son: Bolaños a 46 kilómetros y Huejuquilla el Alto a 97 kilómetros.

Esta ubicación fue pensada y consensuada para dar cobertura principalmente al Pueblo Wixárika, que se encuentra enclavado en la Sierra Madre Occidental y que lo conforman las Comunidades de San Andrés Cohamiata, Santa Catarina Cuexcomatitlán y San Sebastián Teponahuaxtlán y su Anexo Tuxpan de Bolaños, asentadas en los Municipios de Mezquitic y Bolaños, al norte del Estado de Jalisco; además con posibilidad de dar atención a otros pueblos y comunidades aledaños.